L’USTA a signé de nombreuses conventions de partenariat avec des institutions d’enseignement et de recherche, des formations sanitaires :
- Conventions nationales
- Université de Ouagadougou, actuelle Université Joseph Ki-Zerbo (UJKZ) ;
- Université Ouaga II, actuelle Université Thomas SANKARA (UTS) ;
- Université catholique de l’Afrique de l’ouest – Unité universitaire de Bobo-Dioulasso (UCAO-UUB) ;
- Centre de recherche biomoléculaire (CERBA) ;
- Institut supérieur d’informatique de gestion, actuelle Université Aube Nouvelle (U-AUBEN) ;
- Institut supérieur polytechnique privé (ISPP) ;
- Centre Hospitalier Universitaire Yalgado Ouédraogo (CHU-YO) ;
- Centre Hospitalier Universitaire Pédiatrique Charles de Gaulle (CHUP-CDG) ;
- Chaire UNESCO de bioéthique ;
- Institut de formation et de recherche interdisciplinaires en sciences de la santé et de l’éducation (IFRISSE) ;
- Université Norbert ZONGO (UNZ) ;
- Institut africain de santé publique (IASP) ;
- Université de Ouahigouya (UOHG) ;
- Hôpital Paul IV ;
- Hôpital Saint Camille de Ouagadougou (HOSCO).
- Conventions internationales
- Université catholique de Lille (France) ;
- Université catholique de Fu-Jen (Taïwan) ;
- Université de Camerino (Italie) ;
- Université Duquesne (États-Unis d’Amérique) ;
- Université Alassane Ouattara (UAO) (Côte d’Ivoire) ;
- Université de Rome Tor Vergata (Italie) ;
- Centre africain d’études supérieures en gestion (CESAG)(Sénégal).